За 2017 год в департамент поступило 942 заявления о предоставлении водных объектов в пользование. Общее количество действующих разрешительных документов на право пользования поверхностными водными объектами на территории Ямало-Ненецкого автономного округа по состоянию на 1 января 2018 года составляет 1 775.
В соответствии с Водным кодексом РФ водные объекты предоставляются в пользование на основании договоров водопользования для забора воды и использования акватории водных объектов для флота и решений о предоставлении водных объектов в пользование для строительства и реконструкции мостов, трубопроводов и других линейных объектов, разведки и добычи полезных ископаемых, сброса сточных вод и т. п. Уполномоченным органом по предоставлению водных объектов в пользование на территории округа является департамент природно-ресурсного регулирования, лесных отношений и развития нефтегазового комплекса ЯНАО.